Primjenom Zakona o jedinstvenom sustavu registracije, kontrole i naplate doprinosa registracija pravnih osoba, drugih organizacija i poduzetnika vrši se sukladno Pravilniku o dodjeljivanju identifikacijskih brojeva i poreznoj registraciji poreznih obveznika na teritoriji Federacije Bosne i Hercegovine (“Službene novine Federacije BiH”, br.39/02,01/03 i 11/04).

Obveznik uplate doprinosa (poslodavac) podnosi potpisanu i ovjerenu prijavu (JS 3100) za upis u Jedinstveni sustav u ispostavi Porezne uprave prema prebivalištu zaposlenika najkasnije sedam dana od dana otpočinjanja rada zaposlenika, ili od dana koji je određen rješenjem o utvrđivanju prava na osiguranje.

Dragovoljni obveznik uplate doprinosa ili osoba koja samostalno uplaćuje zdravstveno osiguranje osobnim sredstvima također  podnosi prijavu (JS 3110) za upis u Jedinstveni sustav u ispostavi porezne uprave u mjestu prebivališta ili boravišta, a temeljem rješenja nadležnog zavoda zdravstvenog osiguranja kojim se dozvoljava osiguranje na dobrovoljnoj osnovi, odnosno uplata zdravstvenog osiguranja.

Registracija članova obitelji osiguranika ostala je u nadležnosti zavoda zdravstvenog osiguranja, a vrši se na način da obveznik osiguranja (poslodavac) upućuje zahtjev za registraciju članova obitelji osiguranika u područni ured Zavoda zdravstvenog osiguranja HNŽ/K. Temeljem zaprimljenog zahtjeva Zavod izdaje propisanu tiskanica (ZO 3) koju poslodavac popunjava, ovjerava i vraća u područni ured ZZO – a HNŽ/K u mjestu  prebivališta osiguranika.  

Nakon što  referent osiguranja u područnom uredu popuniti predviđene rubrike obrasca vrši se registracija članova obitelji osiguranika i izdaju zdravstvene iskaznice. Dva primjerka tiskanice ZO3 se dostavljaju poslodavcu (jedan primjerak za poslodavca i jedan primjerak tiskanice za osiguranika).

Odjava osiguranikaprijavljenog u Jedinstveni sustav nastaje kada se osiguranik odjavljuje s osiguranja na koje je bio prijavljen. Odjava se vrši na način da obveznik uplate doprinosa (poslodavac) popunjava tiskanicu (JS 3100) koja se podnosi poreznoj upravi u roku od sedam dana od dana prestanka osnova za osiguranje.

Odjavom s dragovoljnog osiguranja, obveznik uplate doprinosa dužan je poreznoj upravi dostaviti sljedeće dokumente za odjavu:

1.Odjava osiguranja za vrstu osiguranja sa kojeg se odjavljuje (JS 3110).

2.Rješenje nadležnog zavoda o prestanku dragovoljnog osiguranja, odnosno osiguranja osobnim sredstvima.

Odjava članova obitelji osiguranika se također vrši od strane poslodavca na primjerku tiskanice ZO3.